Disable UnstructuredGrid VTK output.
UnstructuredGrid is deeply tied to core, and is disabled for now. writeVtk should be rewritten to use EclipseGrid as input or something similar, but support is dropped in its current state.
This commit is contained in:
Jørgen Kvalsvik
@@ -19,7 +19,7 @@
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#include "config.h"
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#include <opm/output/vtk/writeVtkData.hpp>
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#include <opm/core/grid.h>
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#include <opm/common/OpmLog/OpmLog.hpp>
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#include <opm/common/ErrorMacros.hpp>
|
||||
#include <boost/lexical_cast.hpp>
|
||||
#include <set>
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@@ -138,180 +138,182 @@ namespace Opm
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int Tag::indent_ = 0;
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void writeVtkData(const UnstructuredGrid& grid,
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const std::map< std::string, const std::vector< double >* >& data,
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std::ostream& os)
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void writeVtkData(const UnstructuredGrid& ,
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const std::map< std::string, const std::vector< double >* >& ,
|
||||
std::ostream& )
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{
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if (grid.dimensions != 3) {
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OPM_THROW(std::runtime_error, "Vtk output for 3d grids only");
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}
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os.precision(12);
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os << "<?xml version=\"1.0\"?>\n";
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PMap pm;
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pm["type"] = "UnstructuredGrid";
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||||
Tag vtkfiletag("VTKFile", pm, os);
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Tag ugtag("UnstructuredGrid", os);
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||||
int num_pts = grid.number_of_nodes;
|
||||
int num_cells = grid.number_of_cells;
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||||
pm.clear();
|
||||
pm["NumberOfPoints"] = boost::lexical_cast<std::string>(num_pts);
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||||
pm["NumberOfCells"] = boost::lexical_cast<std::string>(num_cells);
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||||
Tag piecetag("Piece", pm, os);
|
||||
{
|
||||
Tag pointstag("Points", os);
|
||||
pm.clear();
|
||||
pm["type"] = "Float64";
|
||||
pm["Name"] = "Coordinates";
|
||||
pm["NumberOfComponents"] = "3";
|
||||
pm["format"] = "ascii";
|
||||
Tag datag("DataArray", pm, os);
|
||||
for (int i = 0; i < num_pts; ++i) {
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||||
Tag::indent(os);
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||||
os << grid.node_coordinates[3*i + 0] << ' '
|
||||
<< grid.node_coordinates[3*i + 1] << ' '
|
||||
<< grid.node_coordinates[3*i + 2] << '\n';
|
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}
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||||
}
|
||||
{
|
||||
Tag cellstag("Cells", os);
|
||||
pm.clear();
|
||||
pm["type"] = "Int32";
|
||||
pm["NumberOfComponents"] = "1";
|
||||
pm["format"] = "ascii";
|
||||
std::vector<int> cell_numpts;
|
||||
cell_numpts.reserve(num_cells);
|
||||
{
|
||||
pm["Name"] = "connectivity";
|
||||
Tag t("DataArray", pm, os);
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||||
int hf = 0;
|
||||
for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
std::set<int> cell_pts;
|
||||
for (; hf < grid.cell_facepos[c+1]; ++hf) {
|
||||
int f = grid.cell_faces[hf];
|
||||
const int* fnbeg = grid.face_nodes + grid.face_nodepos[f];
|
||||
const int* fnend = grid.face_nodes + grid.face_nodepos[f+1];
|
||||
cell_pts.insert(fnbeg, fnend);
|
||||
}
|
||||
cell_numpts.push_back(cell_pts.size());
|
||||
Tag::indent(os);
|
||||
std::copy(cell_pts.begin(), cell_pts.end(),
|
||||
std::ostream_iterator<int>(os, " "));
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||||
os << '\n';
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
{
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||||
pm["Name"] = "offsets";
|
||||
Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
int offset = 0;
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||||
const int num_per_line = 10;
|
||||
for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
if (c % num_per_line == 0) {
|
||||
Tag::indent(os);
|
||||
}
|
||||
offset += cell_numpts[c];
|
||||
os << offset << ' ';
|
||||
if (c % num_per_line == num_per_line - 1
|
||||
|| c == num_cells - 1) {
|
||||
os << '\n';
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
std::vector<int> cell_foffsets;
|
||||
cell_foffsets.reserve(num_cells);
|
||||
{
|
||||
pm["Name"] = "faces";
|
||||
Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
const int* fp = grid.cell_facepos;
|
||||
int offset = 0;
|
||||
for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
Tag::indent(os);
|
||||
os << fp[c+1] - fp[c] << '\n';
|
||||
++offset;
|
||||
for (int hf = fp[c]; hf < fp[c+1]; ++hf) {
|
||||
int f = grid.cell_faces[hf];
|
||||
const int* np = grid.face_nodepos;
|
||||
int f_num_pts = np[f+1] - np[f];
|
||||
Tag::indent(os);
|
||||
os << f_num_pts << ' ';
|
||||
++offset;
|
||||
std::copy(grid.face_nodes + np[f],
|
||||
grid.face_nodes + np[f+1],
|
||||
std::ostream_iterator<int>(os, " "));
|
||||
os << '\n';
|
||||
offset += f_num_pts;
|
||||
}
|
||||
cell_foffsets.push_back(offset);
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
{
|
||||
pm["Name"] = "faceoffsets";
|
||||
Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
const int num_per_line = 10;
|
||||
for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
if (c % num_per_line == 0) {
|
||||
Tag::indent(os);
|
||||
}
|
||||
os << cell_foffsets[c] << ' ';
|
||||
if (c % num_per_line == num_per_line - 1
|
||||
|| c == num_cells - 1) {
|
||||
os << '\n';
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
{
|
||||
pm["type"] = "UInt8";
|
||||
pm["Name"] = "types";
|
||||
Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
const int num_per_line = 10;
|
||||
for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
if (c % num_per_line == 0) {
|
||||
Tag::indent(os);
|
||||
}
|
||||
os << "42 ";
|
||||
if (c % num_per_line == num_per_line - 1
|
||||
|| c == num_cells - 1) {
|
||||
os << '\n';
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
{
|
||||
pm.clear();
|
||||
if (data.find("saturation") != data.end()) {
|
||||
pm["Scalars"] = "saturation";
|
||||
} else if (data.find("pressure") != data.end()) {
|
||||
pm["Scalars"] = "pressure";
|
||||
}
|
||||
Tag celldatatag("CellData", pm, os);
|
||||
pm.clear();
|
||||
pm["NumberOfComponents"] = "1";
|
||||
pm["format"] = "ascii";
|
||||
pm["type"] = "Float64";
|
||||
for (auto dit = data.begin(); dit != data.end(); ++dit) {
|
||||
pm["Name"] = dit->first;
|
||||
const std::vector<double>& field = *(dit->second);
|
||||
const int num_comps = field.size()/grid.number_of_cells;
|
||||
pm["NumberOfComponents"] = boost::lexical_cast<std::string>(num_comps);
|
||||
Tag ptag("DataArray", pm, os);
|
||||
const int num_per_line = num_comps == 1 ? 5 : num_comps;
|
||||
for (int item = 0; item < num_cells*num_comps; ++item) {
|
||||
if (item % num_per_line == 0) {
|
||||
Tag::indent(os);
|
||||
}
|
||||
double value = field[item];
|
||||
if (std::fabs(value) < std::numeric_limits<double>::min()) {
|
||||
// Avoiding denormal numbers to work around
|
||||
// bug in Paraview.
|
||||
value = 0.0;
|
||||
}
|
||||
os << value << ' ';
|
||||
if (item % num_per_line == num_per_line - 1
|
||||
|| item == num_cells - 1) {
|
||||
os << '\n';
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
}
|
||||
OpmLog::warning( "Writing VTK grid data is disabled." );
|
||||
|
||||
// if (grid.dimensions != 3) {
|
||||
// OPM_THROW(std::runtime_error, "Vtk output for 3d grids only");
|
||||
// }
|
||||
// os.precision(12);
|
||||
// os << "<?xml version=\"1.0\"?>\n";
|
||||
// PMap pm
|
||||
// pm["type"] = "UnstructuredGrid";
|
||||
// Tag vtkfiletag("VTKFile", pm, os);
|
||||
// Tag ugtag("UnstructuredGrid", os);
|
||||
// int num_pts = grid.number_of_nodes;
|
||||
// int num_cells = grid.number_of_cells;
|
||||
// pm.clear();
|
||||
// pm["NumberOfPoints"] = boost::lexical_cast<std::string>(num_pts);
|
||||
// pm["NumberOfCells"] = boost::lexical_cast<std::string>(num_cells);
|
||||
// Tag piecetag("Piece", pm, os);
|
||||
// {
|
||||
// Tag pointstag("Points", os);
|
||||
// pm.clear();
|
||||
// pm["type"] = "Float64";
|
||||
// pm["Name"] = "Coordinates";
|
||||
// pm["NumberOfComponents"] = "3";
|
||||
// pm["format"] = "ascii";
|
||||
// Tag datag("DataArray", pm, os);
|
||||
// for (int i = 0; i < num_pts; ++i) {
|
||||
// Tag::indent(os);
|
||||
// os << grid.node_coordinates[3*i + 0] << ' '
|
||||
// << grid.node_coordinates[3*i + 1] << ' '
|
||||
// << grid.node_coordinates[3*i + 2] << '\n';
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// {
|
||||
// Tag cellstag("Cells", os);
|
||||
// pm.clear();
|
||||
// pm["type"] = "Int32";
|
||||
// pm["NumberOfComponents"] = "1";
|
||||
// pm["format"] = "ascii";
|
||||
// std::vector<int> cell_numpts;
|
||||
// cell_numpts.reserve(num_cells);
|
||||
// {
|
||||
// pm["Name"] = "connectivity";
|
||||
// Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
// int hf = 0;
|
||||
// for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
// std::set<int> cell_pts;
|
||||
// for (; hf < grid.cell_facepos[c+1]; ++hf) {
|
||||
// int f = grid.cell_faces[hf];
|
||||
// const int* fnbeg = grid.face_nodes + grid.face_nodepos[f];
|
||||
// const int* fnend = grid.face_nodes + grid.face_nodepos[f+1];
|
||||
// cell_pts.insert(fnbeg, fnend);
|
||||
// }
|
||||
// cell_numpts.push_back(cell_pts.size());
|
||||
// Tag::indent(os);
|
||||
// std::copy(cell_pts.begin(), cell_pts.end(),
|
||||
// std::ostream_iterator<int>(os, " "));
|
||||
// os << '\n';
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// {
|
||||
// pm["Name"] = "offsets";
|
||||
// Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
// int offset = 0;
|
||||
// const int num_per_line = 10;
|
||||
// for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
// if (c % num_per_line == 0) {
|
||||
// Tag::indent(os);
|
||||
// }
|
||||
// offset += cell_numpts[c];
|
||||
// os << offset << ' ';
|
||||
// if (c % num_per_line == num_per_line - 1
|
||||
// || c == num_cells - 1) {
|
||||
// os << '\n';
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// std::vector<int> cell_foffsets;
|
||||
// cell_foffsets.reserve(num_cells);
|
||||
// {
|
||||
// pm["Name"] = "faces";
|
||||
// Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
// const int* fp = grid.cell_facepos;
|
||||
// int offset = 0;
|
||||
// for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
// Tag::indent(os);
|
||||
// os << fp[c+1] - fp[c] << '\n';
|
||||
// ++offset;
|
||||
// for (int hf = fp[c]; hf < fp[c+1]; ++hf) {
|
||||
// int f = grid.cell_faces[hf];
|
||||
// const int* np = grid.face_nodepos;
|
||||
// int f_num_pts = np[f+1] - np[f];
|
||||
// Tag::indent(os);
|
||||
// os << f_num_pts << ' ';
|
||||
// ++offset;
|
||||
// std::copy(grid.face_nodes + np[f],
|
||||
// grid.face_nodes + np[f+1],
|
||||
// std::ostream_iterator<int>(os, " "));
|
||||
// os << '\n';
|
||||
// offset += f_num_pts;
|
||||
// }
|
||||
// cell_foffsets.push_back(offset);
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// {
|
||||
// pm["Name"] = "faceoffsets";
|
||||
// Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
// const int num_per_line = 10;
|
||||
// for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
// if (c % num_per_line == 0) {
|
||||
// Tag::indent(os);
|
||||
// }
|
||||
// os << cell_foffsets[c] << ' ';
|
||||
// if (c % num_per_line == num_per_line - 1
|
||||
// || c == num_cells - 1) {
|
||||
// os << '\n';
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// {
|
||||
// pm["type"] = "UInt8";
|
||||
// pm["Name"] = "types";
|
||||
// Tag t("DataArray", pm, os);
|
||||
// const int num_per_line = 10;
|
||||
// for (int c = 0; c < num_cells; ++c) {
|
||||
// if (c % num_per_line == 0) {
|
||||
// Tag::indent(os);
|
||||
// }
|
||||
// os << "42 ";
|
||||
// if (c % num_per_line == num_per_line - 1
|
||||
// || c == num_cells - 1) {
|
||||
// os << '\n';
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// {
|
||||
// pm.clear();
|
||||
// if (data.find("saturation") != data.end()) {
|
||||
// pm["Scalars"] = "saturation";
|
||||
// } else if (data.find("pressure") != data.end()) {
|
||||
// pm["Scalars"] = "pressure";
|
||||
// }
|
||||
// Tag celldatatag("CellData", pm, os);
|
||||
// pm.clear();
|
||||
// pm["NumberOfComponents"] = "1";
|
||||
// pm["format"] = "ascii";
|
||||
// pm["type"] = "Float64";
|
||||
// for (auto dit = data.begin(); dit != data.end(); ++dit) {
|
||||
// pm["Name"] = dit->first;
|
||||
// const std::vector<double>& field = *(dit->second);
|
||||
// const int num_comps = field.size()/grid.number_of_cells;
|
||||
// pm["NumberOfComponents"] = boost::lexical_cast<std::string>(num_comps);
|
||||
// Tag ptag("DataArray", pm, os);
|
||||
// const int num_per_line = num_comps == 1 ? 5 : num_comps;
|
||||
// for (int item = 0; item < num_cells*num_comps; ++item) {
|
||||
// if (item % num_per_line == 0) {
|
||||
// Tag::indent(os);
|
||||
// }
|
||||
// double value = field[item];
|
||||
// if (std::fabs(value) < std::numeric_limits<double>::min()) {
|
||||
// // Avoiding denormal numbers to work around
|
||||
// // bug in Paraview.
|
||||
// value = 0.0;
|
||||
// }
|
||||
// os << value << ' ';
|
||||
// if (item % num_per_line == num_per_line - 1
|
||||
// || item == num_cells - 1) {
|
||||
// os << '\n';
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
// }
|
||||
}
|
||||
|
||||
} // namespace Opm
|
||||
|
||||
@@ -39,7 +39,7 @@ namespace Opm
|
||||
std::ostream& os);
|
||||
|
||||
/// Vtk output for general grids.
|
||||
void writeVtkData(const UnstructuredGrid& grid,
|
||||
void writeVtkData(const UnstructuredGrid& ,
|
||||
const std::map< std::string, const std::vector< double >* >& data,
|
||||
std::ostream& os);
|
||||
} // namespace Opm
|
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